Isothermal DNA amplification using the T4 replisome: circular nicking endonuclease-dependent amplification and primase-based whole-genome amplification
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Isothermal DNA amplification using the T4 replisome: circular nicking endonuclease-dependent amplification and primase-based whole-genome amplification
In vitro reconstitution of the bacteriophage T4 replication machinery provides a novel system for fast and processive isothermal DNA amplification. We have characterized this system in two formats: (i) in circular nicking endonuclease-dependent amplification (cNDA), the T4 replisome is supplemented with a nicking endonuclease (Nb.BbvCI) and a reverse primer to generate a well-defined uniform do...
متن کاملPrimase-based whole genome amplification
In vitro DNA amplification methods, such as polymerase chain reaction (PCR), rely on synthetic oligonucleotide primers for initiation of the reaction. In vivo, primers are synthesized on-template by DNA primase. The bacteriophage T7 gene 4 protein (gp4) has both primase and helicase activities. In this study, we report the development of a primase-based Whole Genome Amplification (pWGA) method,...
متن کاملHelicase-dependent isothermal DNA amplification.
Polymerase chain reaction is the most widely used method for in vitro DNA amplification. However, it requires thermocycling to separate two DNA strands. In vivo, DNA is replicated by DNA polymerases with various accessory proteins, including a DNA helicase that acts to separate duplex DNA. We have devised a new in vitro isothermal DNA amplification method by mimicking this in vivo mechanism. He...
متن کاملNickase-dependent isothermal DNA amplification
We developed a nicking endonuclease dependent DNA amplification (NDA), using Nt.BstNBI to catalyze single-stranded nick on double-stranded DNA, and Bst DNA polymerase to make extension while sealing the nick and displacing the downstream strand. The displaced single-stranded DNA thereby serves as template for primers hybridization and extension, resulting in exponential synthesis of target DNA ...
متن کاملبررسی کارایی روشLAMP (Loop-mediated isothermal DNA amplification)
مقدمه:سالمونلاها از مهمترین باکتری های بیماری و عامل تیفوئید، باکتریمی، آنتروکولیت و سالمونلوز است که از عفونت های مشترک انسان و حیوانات می باشد. بیماریهای ناشی از این عامل یک معضل بزرگ بهداشتی در جهان به خصوص در کشورهای در حال توسعه از جمله کشور ما می باشد. بنابراین تشخیص سریع، دقیق و به موقع آن برای جلوگیری از اپیدمی و عوارض مخرب این باکتری ضروری به نظر می رسد. برای تشخیص سالمونلا روش های مخت...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Nucleic Acids Research
سال: 2010
ISSN: 0305-1048,1362-4962
DOI: 10.1093/nar/gkq795